五、日本侵占中國南海諸島
對于法屬印度支那殖民當局派警察侵占中國西沙群島的行動，日本當即予以強烈反對。日本外務省發言人聲稱，“我們承認（西沙群島）是屬于中國領土”。日本駐法大使也到法國外交部表示抗議，“堅持該島系屬中國”。當然，中國政府和顧維鈞都意識到，日本當時主張西沙群島“主權之屬華”，“甚至向法抗議”，其真正意圖在窺伺西沙群島。
1939年2月，日軍占領海南島，旋即占據西沙和南沙群島，將島上法國人及其雇傭人員全部驅離。不過，日本對于南海諸島肆無忌憚地實施占領，并未引起法國的武裝反擊，英美等國也采取緘默態度。這也從另一方面印證：南海諸島主權屬于中國，在當時就是不爭的事實。
被日侵占時期，南沙群島成為日軍向東南亞侵犯的前進基地，日軍在島上修建了潛艇基地、飛機場、電臺、氣象臺、燈塔、浮標、修理廠等軍事設施。太平洋戰爭后期，盟軍空軍數度對南沙群島實施空襲，島上所有建筑和設施都被摧毀。
六、中國收復南海主權的國際法依據
1943年11月23日至26日的開羅會議期間，羅斯福同蔣介石共舉行了4次會談，構建了日本投降后亞太地區國際新秩序的框架。即：1.日本攫取中國之土地應歸還中國；2.太平洋上日本所強占之島嶼，應永久予以剝奪；3.日本潰敗后，應使朝鮮獲得自由與獨立；4.關于戰后日本在華公私產業，應完全由中國政府接收。這就是《開羅宣言》的基本內容。1943年12月1日發表的《開羅宣言》規定：“日本所竊取于中國之領土，例如東北四省、臺灣、澎湖列島等，歸還中國。”
1943年11月28日至12月1日，蘇、美、英三國首腦在德黑蘭舉行會議。會前，羅斯福向斯大林通報了開羅會議內容，并將開羅宣言文本交給斯大林看。1943年11月30日，丘吉爾征詢斯大林對于《開羅宣言》意見時，斯大林稱他完全贊成“宣言及其全部內容”，并明確表示：這一決定是“正確的”，“朝鮮應該獨立，滿洲、臺灣和澎湖等島嶼應該回歸中國”。
1945年7月26日發表的《波茨坦公告》重申“《開羅宣言》之條件必須實施”，賦予了戰后中國收回被日本侵占領土和海島的權利。
七、抗戰勝利與國民政府收復南海諸島主權
1.臺灣行政長官公署接收“新南群島”。
1945年8月15日，日本戰敗投降。依據《開羅宣言》和《波茨坦公告》，根據盟軍最高統帥的命令，中國負責南海各島嶼的受降事務。1945年8月中旬，南海諸島日軍撤至海南島榆林港集中，候命遣返回日。26日，日本人完全退出其占據的南海諸島。
1945年10月25日臺灣光復后，臺灣省氣象局于12月8日派員自高雄乘“成田號”帆船出發，先后前往西沙群島的林島（永興島）、林康島（東島）登陸，并“植牌豎旗，以示西沙失土重歸版圖”。
1946年8月，臺灣省行政長官陳儀向國民政府外交部報告了前高雄州高雄市管轄的新南群島即為戰前和戰時先后被法屬印度支那和日本侵占的我國領土西沙群島和南沙群島。陳儀并報稱，“本省光復后將該群島改劃高雄縣管轄，并準備本年四月間前往接收”，但因新南群島原為西沙和南沙群島各一部分，故而請示行政院該群島“是否仍由本省接管？”該電報還附上了臺灣省氣象局撰寫的《新南群島調查報告》和《新南群島概況》日文譯件。
國民政府對臺灣的接收，從國際法角度講，連帶完成了中國政府對其所管轄新南群島（即中國南海諸島）的接收，并享受了第二次世界大戰戰勝國收復被侵占領土的權利。
